1 августа 1983 г. рукоположен во диакона, на следующий день — во иерея, в 1985 г. возведен в сан протоиерея. В декабре 1983 г. назначен ключарем, а в ноябре 1987 г. — настоятелем Серафимовского кафедрального собора в Кирове. В 1986-1989 гг. — секретарь Кировского епархиального управления.
21 сентября 1989 г. пострижен в монашество с именем Александр в честь св. Александра Свирского, 24 сентября возведен в сан архимандрита. 27 сентября 1989 г. в Богоявленском соборе г. Москвы хиротонисан во епископа Костромского и Галичского.
В 1990 г. — депутат Костромского областного Совета народных депутатов.
25 января 1991 г. на I Съезде православной молодежи избран председателем Всецерковного православного молодежного движения.
В апреле 1992 г. Архиерейским Собором Русской Православной Церкви избран председателем Комиссии по изучению деятельности спецслужб в Церкви.
11 ноября 1994 г. включен в состав Совета по делам молодежи при Президенте России.
Решением Священного Синода от 5 марта 2010 г. освобожден от управления Костромской епархией и назначенуправляющим Астанайской епархией (журнал № 5). Также решением Синода архиепископу Александру благословлено временное исполнение обязанностей председателя Синодального отдела по делам молодежи.
Решением Священного Синода от 26 июля 2010 г. (журнал № 68) архиепископу Александру как главе Митрополичьего округа Русской Православной Церкви в Республике Казахстан присвоен титул Астанайский и Казахстанский.
Распоряжением Святейшего Патриарха Кирилла от 14 марта 2012 г. назначен настоятелем храма святых мучениц Веры, Надежды, Любови и матери их Софии на Миусском кладбище в Москве — Патриаршего подворья и представительства Митрополичьего округа Русской Православной Церкви в Республике Казахстан.